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沙棘叶、皮、果实及种子在医药上有着特殊效能。沙棘果能够活血散淤、化痰舒胸、补脾健胃，还能治疗跌打损伤、淤肿、咳嗽、呼吸困难、消化不良等疾病。经常食用沙棘制成品，可增进人的心肌功能，治愈胸闷和气短等症状，与降压药合用有协调作用，可降低血胆固醇和甘油三脂。沙棘种子可治疗肺结核、胃溃疡、月经不调等病症。沙棘油是良好的外伤药，可用于治疗烧伤、冻伤和各种皮炎。
沙棘的嫩枝、嫩叶是牛、羊的精饲料，被人誉为"铁杆牧草"，不仅能使牲畜增膘健体、毛色明亮，还能起免疫作用。
沙棘又是半干旱黄土高原迅速绿化荒山、保持水土、调节生态平衡及促进农林牧业发展的良好树种。
研究发现，沙棘黄酮及其β-谷固醇、甜菜碱等活性物质具有降低血压、防止动脉粥样硬化、降低血粘度、降低血液中胆固醇、提高高密度脂蛋白及清除血管壁的沉积物、增加冠状动脉血流量和增强心功能等作用。沙棘黄酮可以通过清除活性氧自由基起到抗心律失常、抗心肌缺血、缓解心绞痛和改善心功能的作用，并有助改善脑缺血，提高大脑供氧能力，从而对脑血管病及偏瘫、痴呆等症有一定康复作用。
沙棘总黄酮等生物活性成分对免疫系统的多环节都具有不同程度的调节能力，对体液免疫有明显的调节作用，还有一定的抗过敏作用，因而临床可用其治疗多种免疫系统免疫功能低下及人体新陈代谢功能不足等病症。黄酮类化合物还可调节甲状腺功能，有助甲状腺功能亢进恢复。
