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滴灌的使用最大的缺点就是由于他的毛管的孔口非常的小，所以极其容易发生堵塞的现象。一般造成这种情况的原因就是水质不佳，或者是孔口的位置结垢。要避免这种情况的发生，一定要保证水源的质量，一般可增设一个过滤器。由于滴灌需要铺设到作物的根部位置，在整理地块的时候，需要回收滴灌带。
滴灌带
灌水器的工作水头越高，灌水均匀度易保证，但系统的运行费用高。灌水器的设计工作水头应根据地形和所选用的灌水器的水力性能决定。单翼迷宫式滴灌带的工作压力最好在0.05-0.1MPa之间，注意应根据所选滴灌带滴头的流态指数及其实际工作水头确定滴头实际出流量以及相应的允许水头差。
以Φ16x300-1.8滴灌带为例说明( qd =0.411H0.615 )
Hd=10m时，qd=1.8l/h
qv=0.2，则[hv]=0.33，[h]= [hv] Hd="0".33x10=3.3
Hd=5m时，qd=1.1l/h
qv=0.2，则[hv]=0.33，[h]= [hv] Hd="0".33x5=1.65
