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氢气治疗慢性阻塞性肺损伤
肺的炎症损伤是一大类非常重要的疾病。考虑到氢气在炎症方面的重要保护作用，特别针对肺的炎症损伤进行研究探讨意义重大。目前关于氢气保护肺部损伤的研究有肠缺血后肺损伤，氧气诱导慢性肺损伤，百草枯诱导的肺损伤以及肺移植后的缺血再灌注损伤。
氢气清除羟基自由基和亚硝酸阴离子，具有特异性，可治疗各种氧化损伤。氢气能有效减少脂质和核酸过氧化，提高细胞抗氧化能力，从而保护细胞减少氧化损伤。人体内许多自由基属于活性氧，包括羟基自由基、超氧阴离子和亚硝酸阴离子等。正常环境下，细胞在一些酶和抗氧化物质的协助下，可保持活性氧在产生和清除之间的动态稳定。这种平衡一旦被打破，将导致氧化应激和各种疾病。
慢性阻塞性肺损伤是一种典型的氧化损伤类疾病。一些研究发现，活性氧是导致慢性阻塞性肺损伤的重要因素，一些抗氧化物质能有效治疗该类疾病。氢气的抗氧化特性可有效治疗该类疾病的氧化损伤。理论推测，虽然无法肯定氢气能减少雾霾导致的肺损伤，但是氢气应该能作为空气污染导致肺部疾病的预防手段，甚至可应用于空气污染导致的各种疾病上。
氢分子与线粒体
电离辐射、缺血再灌注、心脏移植、心肺复苏等对心脏的损伤主要是因为产生了活性氧簇，进而引起了心肌细胞的氧化应激，并且引起机体的炎症反应及细胞凋亡。作为细胞能量供应站的线粒体电子传递链是活性氧簇的发源地。在氧化应激状态下，活性氧簇水平与机体抗氧化能力的失衡，将导致线粒体内部的生物大分子被氧化而功能降低或丧失，使线粒体功能受损。而受损的线粒体会产生更多的活性氧簇，如此形成恶性循环。
氢气可进入线粒体，缓解电离辐射、心脏移植、心肺复苏等治疗方式对心脏的损伤。发挥这样的效应是因为氢分子具有抗氧化、抗炎和抗凋亡的功能。氢分子对心脏的保护功效与对心肌线粒体损伤的防护密不可分。从线粒体角度入手，探索氢分子在氧化应激、凋亡、线粒体动态变化以及代谢方面的调节机制是揭示氢分子对心脏损伤防护作用的重要研究思路。
氢气治疗牛皮癣的临床研究
牛皮癣是一种常见的具有特征性皮损的慢性皮肤病，易于复发。其一般分为四种类型，即寻常型、脓包型、关节病型与红皮病型。临床研究中采用三种不同的氢气摄取方法：静脉注射氢气生理盐水，呼吸氢气，饮用富氢水。
分别将采用各种不同氢气治疗方法后的效果与未治疗时进行比较，并分析肿瘤坏死因子、白细胞介素等炎症因子水平。3名牛皮癣患者在摄取氢气后，病情得到缓解，治疗结束时皮肤的典型病变几乎完全消失。3名患者的炎症因子水平与治疗前相比都有不同程度的下降。这些都表明，氢气对牛皮癣的治疗是有积极作用的。
在牛皮癣发病时皮肤会有淋巴细胞浸润和炎症因子的产生。阻断炎症因子效应的治疗方法是目前研究的热点。活性氧是炎症形成的重要因素，甚至有人将活性氧作为炎症因子看待，阻断活性氧能有效抑制炎症反应。氢气作为一种优秀的抗氧化物质，在许多临床研究中发现对代谢综合症、类风湿关节炎等疾病的治疗作用。牛皮癣作为一种典型的慢性皮肤病炎症性疾病，在损伤发生的同时会伴随着羟基自由基和亚硝酸阴离子等活性氧的增加，这正是氢气治疗的重要靶点。