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内置式水箱自洁消毒器和外置式水箱消毒器在结构上的区别：
内置式水箱消毒器是一台臭氧发生器主机和一台曝气罐组成，曝气罐内有曝气盘，而外置式的是一台臭氧发生器里面有水泵和射流器。 两者在与水的混合方式上的不同：内置式水箱自洁消毒器是通过曝气盘和曝气罐与水混合，把臭氧大气泡变成小气泡增大于水的接触面积，从而增加溶解量。外置式的是通过射流器，当水泵吸水产生负压，水流急速通过射流器的狭小管道的时候，外界压力大于射流器压力的时候，臭氧就会被吸入管道与水混合，外置式混合更充分，速度更快。外置式主要安装在水箱外部，水通过25的管道进入设备内消毒，消毒后的水经回水管流到水箱内部;内置式是安装到水箱内部的，机电混合器在 水箱内部安装，控制柜在水箱外部安装，中间通过线缆、气管连接，机电混合器在水箱内 部，机电混合器内有高效混合泵在水箱内部以达到更好的消毒效果。
水箱自洁消毒器是我公司经广泛的市场调查、分析，并由开发部精心研制、开发出的一种新产品，它使用效果显著、经济耐用等诸多优点。由于水箱及水池的水有时长期停留，致使遭受各种微生物、细菌等的污染，而使水的水质指标达不到卫生标准，如果二次污染严重，将威胁着人们的生活。要消灭水箱及水池的二次污染，必须对水进行适当的消毒和定期清洗，而目前各种消毒措施比较繁琐，费用高，有时还要停水，给用户造成一定的不便。本公司研制的WTS系列南通水箱自洁消毒器，通过水的自体循环，同时加入适当的强氧化物质，即可达到对水体的消毒。
根据安装方式的不同，分为水箱内置式和水箱外置式两种。
水箱自洁消毒器工作原理:
水箱自洁消毒器采用微电解物理消毒法对水体进行消毒。能量控制器采用循环脉冲放电控制循环释能器向水中释放能量，其原理在于经过水箱自洁消毒器处理后，水中细菌和藻类的生态环境发生变化，生存条件丧失而死亡。任何一种生物都有其特定的生存生物场。电荷在生物体内的分布个运动，受到生物体外环境电场变化的影响，从而影响机体的生命运动。地球上的微生物一般只能适应并生存于地球表面的电场强度（130V/m）中，改变电场强度，可改变或影响细菌和藻类的生物代谢，如基因表达程序、酶活性等，使细菌和藻类生存环境恶化，达到杀灭细菌和藻类的目的。