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有机肥进人土壤后，在土壤水分、空气、动物及微生物的作用下粉碎、溶解、氧化、分解和合成等过程。肥料中的有机质的一系列的转化过程。发生有机质的转化是按照两个方向进行的:一个是把复杂的有机物质分解为简单的化合物，最后生成水、二氧化碳，氮和无机盐类，称为有机质的矿化过程;过程，称为腐殖化过程。另一个是有机物质经过微生物的深刻分解前者可使养分得到释放，提高土壤肥力水平。
有机肥能够改良土壤，解决了土壤的问题从根本上解决农作物的生长问题。
土壤中的固体颗粒部分，有时是呈单粒状态存在的．但是在许多情况下，因各种因素的影响，则曼大小不同形状各异的团粒，团块状态存在，即通常所说的土壤团聚体．土壤结构是在荒地变成耕作土壤的长期发育过程中形成的，它在一定程度上能反映出耕
作土壤形成发育的一些特征．
施用有机肥料，有利于土壤团粒结构的形成和维持，能够提高土壤的保肥、蓄水能力。据测定，有机质的吸水量可达自身重量的5.6倍，比粘土大10倍，因而能够显著增加土壤的容水量和有效含量。有机质还可吸收并保持大量可溶性物质，尤其对盐类的吸收和保持力更强，一般每百克有机质的平均盐基置换容量为300-400毫克当量，比矿质土粒大5-6倍。有机质还能显著增加土壤的缓冲性，有利于各种矿质营养元素足量、均衡供应。
有机肥培肥土壤实验（二）
红壤性稻田定位试验坡明。秸秆类有机肥还田使水稻土1一0.0 5毫米微团聚体量增多，土壤孔隙性和容重也得到了改善。 北京褐土连年施用鸡粪和鸡粪有机肥后，明显改善了土壤结构性。
土壤微结构特征是，土壤矿物颗粒被有机肢体所粘结，形成大小各异和疏松多孔的团聚体团粒，特构明显，色泽较深，均扫腐殖质侵入体所形成。而单施化肥的_土则土体较紧实，看不到微团聚体的形成。表明长期施用有机肥料，使褐土结构性明显改善，形成了具有较高肥力特征的微结构。
