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地下水水源热泵另一个主要问题是提取过热（冷）量的水如何向地下回灌，必须保证把水最终全部回灌到原来取水的地下含水层，才能不影响地下水的资源状况；把用过的水从地表排掉或排到其他浅层，都将破坏地下水的状况，造成对水资源的破坏。此外，系统还要设法避免灌到地下的水很快被重新抽回，否则水温就会越来越低（冬季）或越来越高（夏季），使系统性能恶性循环。
地源热泵与传统空调和供热系统相比，具有以下优点：1、资源可再生利用;2、运行费用低，每年运行费用可节省30%左右;3、占地面积小，节约水资源;4、绿色环保，工作过程中没有燃烧、排烟以及不产生废弃物;5、自动化程度高，机组以及系统均可实现自动化控制;6、一机多用，可用于供暖、空调以及制取生活热水。
地源热泵的这些优点使得它成为人们关注的焦点，已经有越来越多的用户开始熟悉地源热泵，同时，政府对此也有一定支持。近几年来，在北京、上海、天津、重庆、山东、河南、湖南、辽宁、江苏、浙江及河北等地，已有大量的地源热泵工程在实际应用，全国地源热泵系统的应用估计超过2000万平方米。
