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从20世纪90年代开始，一些国家开始制定有机农业和有机食品标准，从此，有机农业在法制轨道上得到迅速发展。这里我们看下关于日本的有机农业和有机食品的制度。
1992年，日本农林水产省制订了《有机农产品蔬菜、水果特别表示准则》和《有机农产品生产管理要点》，2001年4月1日，日本正式实施有机食品法(即《日本物资规格化和质量表示标准法规》，简称JAS法)，JAS法规的基本内容包括：农场的生产要求，加工厂的生产要求，包装的生产要求，进口商的要求。此外还规定，有机种植必须采用有机方式种植的种子。只有符合JAS法规要求的产品，才允许使用JAS标志。其后，日本对其JAS法规进行了修改和完善。
修改后的日本JAS法规定，在日本市场上市的农产品有以下5种标志：
1.有机农产品：要求必须在3年以上不使用化肥和农药;加工食品中使用95%以上的有机农产品才能标出经过认证的有机农产品标志。
2.无农药栽培的农产品：完全不使用农药。
3.无化肥栽培的农产品：完全不使用化肥。
4.减农药栽培的农产品：农药投放量低于一般投放量一半的农产品。
5.减化肥栽培的农产品：化肥投放量低于一般投放量一半的农产品。
JAS标准开始执行后，遗传基因转换技术生产的食品不被承认是有机食品。如通过基因转换技术栽培的大豆等，即使是3年以上不使用化肥和农药也不被承认为有机食品。
有机食品资格认证事务由在农林水产省注册的日本国内认证机构批准。
(2)实施有机畜产品认证
日本发现疯牛病后，消费者对食品安全日益关注。为此，日本农水省决定，自2002年起对肉、蛋等畜产品也实施“有机食品”认证制度。对用有机饲料喂养，未使用抗生物质的牛和鸡制作的食品给予“有机食品”的认证。
根据国际有机食品认定机构制定的标准，只使用有机饲料喂养，未使用抗生物质，开放式喂养的畜产品为有机畜产品，以有机畜产品为原料加工的食品为有机产品。日本农水省表示将在国际机构规定的标准基础上制定“有机畜产品”的标准。届时，日本农水省指定的检查机构将定期到农户检查饲养情况，并对符合标准的畜产品给予“有机畜产品”的认证。
另外，澳大利亚、阿根廷、以色列等国敏锐地意识到欧洲有机食品市场的潜力，也已制定出相应的国家有机食品标准，并成功地进入欧盟有机食品第三国名单。
